这是总概括药师如来的所有的愿力和法门。药师法门，就在药师如来的因地所发十二大愿之中圆满地包含了。
药师如来开示我们要建设物质文明，建设精神文明，人人都相好庄严，成就人间净土。所以药师法门的特质，就是不离开现实，而且圆满现实，让我们的现实人生更圆满、更庄严；又是法性法相双融之法；是曼殊室利和执金刚对扬之法；是本师本尊一具之法；是在圆满世间法的同时，成就出世间法；先以欲钩牵、后令入佛智的大法。让我们更透彻地了解我们的身体，就在身体之中来起修，通过饮食、呼吸、睡眠来起修，将凡夫的五浊有漏之身转变为清净无漏的琉璃光身。认识人生，改造人生之法；现前脚下立地起修，圆满成佛之法。所以是非常不可思议的，特别适合于我们现在根机的众生的法要。
现在的人对世间放不下，你要他苦修，他听不进去；现在的人很忙碌，你要他专门抽时间来修，他也很难做到。药师如来不需要你专门抽时间，你就在饮食、呼吸、睡眠之中修，所以不会间断，容易成就。